股份制股份的分配主要按资金股权部分和经营管理股权部分进行分配。资金管理股权分配按照股东各自出资比例进行分配；经营管理分配主要考虑对公司的贡献、劳务支出比例等按照职责和岗位进行分配，贡献越多，职责越高，得到的分配比例越大。
股份分配确定好后，需要订立合同，按规章办事，减少后续分配纠纷。
持股比例的计算公式：
举例：某公司原有回注册金90万，现在某股东新答出资10万元，则该股东持股比例为10÷（90+10）＝10%
持股比例是指出资额占注册资本金的比例，即：出资额/注册资本金。例如本来注册资本金为90万，出资10万，那持股比例就是10/(90+10)也就是占比10%。股东或者章程另有约定的除外。年底的分红也按这个比例进行。
股权分配的核心是公平公正，首先将股权分成资金股权部分和经营管理股权部分，股权分配时注意实现股权价值的最大化，保证创业者拥有对公司的控制权。其中，资金股权的分配应当根据公司初创阶段出资股东的出资比例、公司未来发展需要和出资股东的投资意愿来确定，一般不应当超过50%；经营管理股权的分配应当根据公司的实际经营需要和经营管理能力来确定，一般应当超过50%，但不得超过出资股东所持有的股权比例。
同时，对于参与经营股东的股权也要设计退出机制，比如先期约定在合作过程中，部分参与经营股东无法继续投入人力、无法参与创业公司的经营。在股权分配时，应当充分考虑公司的实际情况和未来发展需要，合理确定各方股东的股权比例，以实现股权价值的最大化和公司的长期稳健发展。