龟背真菌分辨方法如下：
乌龟背甲受到真菌感染后会发白，而换甲和水碱也会导致类似的情况发生，因此要小心甄别。如果将乌龟放到水中，发白的情况就消失，说明是换甲引起的，如果用醋刷背才会消失，则是水碱所致。而真菌会导致龟甲上有白色的斑块，需要用药物治疗才能康复，而且还有复发的风险。
乌龟背甲真菌的感染在肉眼的情况下，难以准确的判断。但是以经验而言，水碱引起的多数是在背甲的四周，真菌会在每个甲片上都有，包括腹甲上有的时候也会看到，最终确定它是不是真菌，还是要带到医院去刮片采样，在显微镜下去看，才能得到准确的真菌的判断。
像有一些龟得了真菌也不用过于担心，如巴西龟，每年角质会出现蜕甲，随着蜕甲，会把附有真菌的甲片退掉，到了第二年又是崭新很漂亮的一只小龟。
应该采取清洁、消毒和抗真菌药物治疗的综合措施。首先，应该将乌龟放入温度适宜的水中，用温水清洗乌龟的背部，然后用消毒剂消毒，最后使用抗真菌药物进行治疗，以加快清除真菌的过程。