1. 乘坐飞机：从台湾本岛的林口机场或桃园机场出发，乘坐小型客机前往马祖南竿机场。航班时间约为50分钟。抵达南竿后，可以乘坐公交车或租用摩托车、电动车等交通工具到达目的地。
2. 乘坐轮船：从台湾宜兰罗东或基隆出发，乘坐轮船前往马祖各岛屿。轮船行驶时间较长，但是费用相对较低。抵达后可选择步行、骑行或者租用交通工具出行。
3. 租用私人船只：如果您需要更加自由和灵活的行程安排，可以考虑租用私人船只前往马祖各岛。
去马祖岛需要办理《大陆居民往来台湾通行证》及旅游签注，申请所需材料如下：
一、申请往来台湾通行证材料
1、符合要求的申请表；
2、符合《出入境证件相片照相指引》的申请人照片；
3、申请人居民身份证原件。不满16周岁未办理居民身份证的可交验居民户口簿，现役的人民解放军军人、人民武装警察交验军人身份证明（军官证、士兵证或者警官证）；
4、在非常住户口所在地申请往来台湾通行证的，还须按照国家移民管理局有关规定，提交符合在非常住户口所在地申请条件的证明材料，按规定向指定受理机构申请的情形除外。
5、登记备案的国家工作人员、军人，应当提交本人所属单位或者上级主管单位按照干部管理权限出具的同意其办理出入境证件的函件，但持“赴台批件”申请赴台的除外。
6、未满16周岁的申请人，还应交验监护关系证明（出生证明、户口簿等），交验监护人居民身份证原件；监护人委托他人陪同的，还须提交监护人委托书，交验被委托人的居民身份证原件。