网上办理港澳通行证签证的流程：

1、登录出入境网站，按提示要求填好相应内容；

2、在申请的第四个工作日后，可登录网站查询申请是否已受理；

3、申请受理后，可以在第10个工作日后，凭有效的港澳通行证、身份证、申请回执编号到市公安局出入境管理处领取签注。网上申请获得审批通过后，要制作签注，必须按规定交费用。

内地居民单独申请往来港澳通行证，需要填写申请表，回答有关询问并提交下列材料：

1、符合《出入境证件相片照相指引》标准的照片；

2、居民身份证原件（身份证件须留存复印件或者电子扫描图片）、未满16周岁交验《居民户口簿》、军人交验军人身份证明；

3、提交或核验指纹信息；

4、在非常住户口所在地申请往来港澳通行证的，提交符合在非常住户口所在地申请条件的证明；

5、军人、登记备案的国家工作人员，提交本人所属单位或者上级主管单位的同意办理出入境证件的函；

6、未实行按需申领护照地区的内地居民，按照有关规定出具相关证明材料。