一般会扣除以下费用或款项：
1. 社会保险费：根据国家规定，雇主需要按照员工工资的一定比例缴纳社会保险费，其中包括养老保险、医疗保险、失业保险和工伤保险。生育金也会按照这一比例进行缴纳。
2. 个人所得税：根据国家税法，个人收入达到一定标准后需要缴纳个人所得税。生育金也按照一定比例进行个人所得税扣除。
3. 其他扣除项：根据公司政策或劳动合同的约定，生育金单位可能还会扣除其他费用，如公积金、个人借款、社团会费等。这些扣除项需要根据具体情况而定。
需要注意的是，不同地区和不同公司的扣除标准可能会有所不同，具体扣除项目和费用也会有所差异。为了了解自己的具体扣除情况，建议咨询公司人力资源部门或劳动保障部门。
一般情况下，女职工在分娩后的两个月内可以向当地社保机构申请领取生育津贴待遇1。
但是也有部分地区规定生育津贴要在3-6个月内申请，以手术后分娩后开始计算2。此外，根据我国相关法律规定，女职工在生育期间享受产假或计划生育手术休假时可以开始申请生育津贴3。因此，具体的申领时间以当地的规定为准。
生育金单位在发放生育津贴时，通常会扣除一些费用。这些费用包括但不限于：社会保险费、个人所得税、医疗费用、住院费用、手术费用、药品费用等。
此外，还可能根据国家或地区的相关政策规定，扣除其他费用，例如住房公积金、失业保险金等。具体扣除项目会因地区、单位政策的不同而有所差异。生育金单位要扣除这些费用是为了保证生育津贴的合法性和公平性，确保福利金的合理使用。