双塔山寺庙内部包含以下部分：

石碑及通往大殿的门：在这些碑石的后面，有一个大门，进入后可以看到一个新的园子。

大殿：可能是寺庙的主要场所，用于供奉佛像或进行宗教仪式。

东西房：寺庙的东西两边各有四五间的房子，这些是全砖结构的古建筑，可能是僧侣或信徒的居住或工作场所。

禅堂和客堂：东面是禅堂，西面是客堂，这可能是它们过去的功能。现在，这些房子的室内墙上挂满了历朝历代各种佛塔的造型及演变图。

此外，寺庙内可能还有其他一些设施，如香炉、神龛等。